以及可在线调整文字样式、图形颜色等,省去后期修图调整的繁琐~~
链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/koenrich.html
03
GO富集分析
仅需筛选目的基因并上传,即可完成GO富集分析?
OmicShare云平台GO富集分析即可实现!
如果是平台有提供背景基因的物种,仅需上传相关物种的Ensembl ID,即可完成分析。当然如果是其他物种,也可以自备带GO号的背景文件,轻松完成分析哦~
各类GO富集图形、GO二级分类柱状图、有向无环图轻松拿下!
链接:
https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/gogseasenior
04
动态GO富集分析
GO富集分析动态版支持在线调整文字样式、图形样式,且可以筛选GO term信息!
链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/goenrich.html
05
GSEA分析
GSEA分析不对基因进行预过滤,从而排除了传统富集分析中“固定阈值”过滤导致的,对微效基因的有效信息挖据不足等问题。可以更全面地对某一功能单位的调节作用进行解释。
OmicShare云平台GSEA工具提供了人、小鼠、大鼠等18种常见物种,可对其进行GSEA分析。
链接:
https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/gsea
06
GSEA动态工具
除了静态工具的常规图形、结果,动态GSEA工具还提供基迪奥开发的GSEA富集分析结果总图,可以将显著富集的通路或者关心的重点通路展示在一张图上,也可以自由选择想展示的通路。不同功能单位中用颜色区分,同时对比多条通路的ES值,可快速锁定目标通路。
链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/report_gsea.html
07
GO分类柱状图
GO二级分类图,其横坐标代表GO三个ontology(molecular function、cellular component、biological process),纵坐标为基因数目,通过图可以读出基因在各GO term中的富集情况及基因数目。
上传含GO注释信息的表格,即可绘制GO二级分类柱状图,提供绘制肩并肩式柱状图及堆叠柱状图两种类型。
链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/osgo
08
富集分析条形图
手头上已经有富集分析数据,想挑选感兴趣的通路/GO term等绘制富集分析条形图?
富集分析条形图可以实现~,且支持KEGG\GO\DO\Reactome类型绘图。
链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/enrich_bar
没有富集分析数据,可以使用平台KEGG\GO\Reactome\DO富集分析、GSEA工具进行分析;如果想基于富集分析数据绘图进行可视化,也可以使用富集圈图、富集气泡图等工具!
OmicShare云平台链接:https://www.omicshare.com/tools/
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