KEGG、GO、DO、Reactome富集分析一键拿捏!

KEGG、GO、DO、Reactome富集分析一键拿捏!

以及可在线调整文字样式、图形颜色等,省去后期修图调整的繁琐~~

链接:

https://www.omicshare.com/tools/home/report/koenrich.html

03

GO富集分析

仅需筛选目的基因并上传,即可完成GO富集分析?

OmicShare云平台GO富集分析即可实现!

如果是平台有提供背景基因的物种,仅需上传相关物种的Ensembl ID,即可完成分析。当然如果是其他物种,也可以自备带GO号的背景文件,轻松完成分析哦~

各类GO富集图形、GO二级分类柱状图、有向无环图轻松拿下!

链接:

https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/gogseasenior

04

动态GO富集分析

GO富集分析动态版支持在线调整文字样式、图形样式,且可以筛选GO term信息!

链接:

https://www.omicshare.com/tools/home/report/goenrich.html

05

GSEA分析

GSEA分析不对基因进行预过滤,从而排除了传统富集分析中“固定阈值”过滤导致的,对微效基因的有效信息挖据不足等问题。可以更全面地对某一功能单位的调节作用进行解释。

OmicShare云平台GSEA工具提供了人、小鼠、大鼠等18种常见物种,可对其进行GSEA分析。

链接:

https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/gsea

06

GSEA动态工具

除了静态工具的常规图形、结果,动态GSEA工具还提供基迪奥开发的GSEA富集分析结果总图,可以将显著富集的通路或者关心的重点通路展示在一张图上,也可以自由选择想展示的通路。不同功能单位中用颜色区分,同时对比多条通路的ES值,可快速锁定目标通路。

链接:

https://www.omicshare.com/tools/home/report/report_gsea.html

07

GO分类柱状图

GO二级分类图,其横坐标代表GO三个ontology(molecular function、cellular component、biological process),纵坐标为基因数目,通过图可以读出基因在各GO term中的富集情况及基因数目。

上传含GO注释信息的表格,即可绘制GO二级分类柱状图,提供绘制肩并肩式柱状图及堆叠柱状图两种类型。

链接:

https://www.omicshare.com/tools/home/report/osgo

08

富集分析条形图

手头上已经有富集分析数据,想挑选感兴趣的通路/GO term等绘制富集分析条形图?

富集分析条形图可以实现~,且支持KEGG\GO\DO\Reactome类型绘图。

链接:

https://www.omicshare.com/tools/home/report/enrich_bar

没有富集分析数据,可以使用平台KEGG\GO\Reactome\DO富集分析、GSEA工具进行分析;如果想基于富集分析数据绘图进行可视化,也可以使用富集圈图、富集气泡图等工具!

OmicShare云平台链接:https://www.omicshare.com/tools/

成为OmicShare 年会员即可无限次免费使用工具;

普通用户可以通过奥币使用工具;

如果您是新注册用户,工具有2次免费试用的机会,欢迎体验!

基迪奥生物

专业定制测序服务

service@genedenovo.com返回搜狐,查看更多

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