幽门螺杆菌建议每年复查一次，体检时复查即可，如果发现幽门螺杆菌阳性，需进行根除治疗，治疗后复查间隔不一样，需要避免在短期内复查。
而要在根除治疗结束以后1个月以上再复查，因为药物本身对幽门螺杆菌有一定抑制作用。如果复查时间太近，可能会出现虽然化验结果是阴性，但实际还存在幽门螺杆菌感染，即假阴性结果。
因此要等药物作用基本消失以后，即1个月以上再进行复查，观察是否根除。如果根除成功，则之后可以1年1次，在体检时进行会比较方便，幽门螺杆菌感染存在一定的复发概率。
成人复发率在20%-30%，与环境中存在幽门螺杆菌有关，随时能接触到幽门螺杆菌，因此会出现复发。如果再次发现感染，可以继续考虑根除治疗。